摘要：
目的 检测并分析武汉地区基因Ⅳ型戊型肝炎(HEV)病毒开放读码框3 (ORF3)基因变异情况.方法 采用逆转录-巢式聚合酶链反应(RT-nPCR)扩增41株基因Ⅳ型HEV RNA两个基因片段(nt5020～nt5392和nt5347～nt5956;参考病毒株:EF570133),并对PCR产物进行测序,然后使用ContigExpress将测序结果拼接(含有HEV ORF3全序列),使用MegAlign (DNA Star软件包)对ORF3进行比对,查看ORF3基因及其编码蛋白变异情况.结果 41株基因Ⅳ型REV RNA两个基因片段均扩增出来的毒株为18株,18株HEV ORF3检测出47个位点存在核苷酸替换,其中21个替换发生在密码子第1、2位核苷酸,26个替换发生在密码子第3位核苷酸;其编码蛋白存在19个位点氨基酸变异.结论 武汉地区基因Ⅳ型HEV ORF3存在多个位点核苷酸替换,这些位点变异在急性戊型肝炎病情进展中有何意义,有待于进一步研究.
