目的对武汉地区戊型肝炎病毒（HEV）开放读码框（ORF）3基因序列进行分析,并确定病毒基因型。方法收集103份抗-HEV IgM阳性血清,采用逆转录-巢式聚合酶链反应扩增HEV RNA两个基因片段（5020～5392 nt和5347～5956 nt,EF570133）;对PCR产物进行测序,并用ContigExpress将测序结果拼接（含有ORF3基因）,对ORF3基因序列进行分析。结果 103份抗-HEV IgM阳性血清中HEV RNA两个基因片段均扩增出来的样本为18份,18株HEV ORF3基因全长均为345 bp,编码114个氨基酸。各毒株间的核苷酸同源性为92.5%～99.4%,与基因Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型HEV的核苷酸同源性分别为83.5%～86.7%、83.2%～85.2%、84.6%～87.2%、92.0%～96.5%;系统进化分析表明该18株HEV均为基因Ⅳ型。结论武汉地区HEV主要为基因Ⅳ型,ORF3基因序列可用于同源进化分析。