摘要：
目的:筛选与胰腺癌干细胞相关的差异表达基因,并进行生物信息学分析.方法:以MIA-PaCa2（TIChigh）与BxPc-3（TIClow）为研究胰腺癌干细胞的工具细胞制备总RNA,经质量鉴定后进行荧光标记;采用Agilent人全基因4*44K芯片进行杂交实验,获得mRNA表达谱;以Gene Spring Software 11.0软件和Quantile算法分析芯片实验数据,筛选与胰腺癌干细胞相关的差异mRNAs;基于Gene Ontology数据库进行GO注释,基于KEGG数据库进行Pathway注释.结果:获得符合基因芯片实验质量标准的RNA样品,基因芯片杂交及数据分析得到差异表达mRNAs 7059个（P(0.05,fold change≥2）,其中MIA-PaCa2（TIChigh）中上调表达3440个,下调表达3619个.GO注释显示他们主要涉及多胺代谢过程、含碱基的小分子相互转换、组蛋白H4乙酰化、细胞分裂、细胞周期、凋亡、Toll样受体信号转导通路等.Pathway注释主要涉及癌症的途径、内吞作用、O-糖基化生物合成、嘧啶代谢、谷胱甘肽代谢等.信号通路调控网络图显示多条信号通路存在交叉对话.结论:筛选出的差异表达基因可能参与胰腺癌干细胞的发生发展,参与不同信号通路的调控,并有可能成为胰腺癌新的治疗靶点.
