目的检测人胰腺癌干细胞对吉西他滨的敏感性,分析其差异性基因的表达,初步阐明其耐药分子机制。方法运用流式技术从人原代胰腺癌和细胞系SW1990中分选CD24+CD44+ESA+细胞,行NOD/SCID鼠移植瘤实验验证其肿瘤干细胞特性;运用吉西他滨进行体内、外干预,检测胰腺癌干细胞凋亡和表达率变化情况。采用人类全基因组表达谱AffymetrixU133plus2.0芯片对胰腺癌干细胞和非干细胞进行差异基因筛选。结果人原代胰腺癌和细胞系SW1990中分选到CD24+CD44+ESA+（0.8%）和CD24+CD44+（3.6%）细胞,移植瘤实验证实其为胰腺癌干细胞。肿瘤干细胞凋亡率及表达率检测提示胰腺癌干细胞对吉西他滨显著耐药。与胰腺癌非干细胞比对,基因表达谱芯片筛查到胰腺癌干细胞820条差异基因,其中上调表达281个,下调表达539个。结论胰腺癌干细胞对吉西他滨耐药,具有特征性基因表达谱,为阐明胰腺癌多药耐药机制及靶向治疗奠定基础。