资源类型:
收录情况:
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-C
文章类型:
单位:
[1] 华中科技大学同济医学院附属同济医院第二临床学院
中国医科大学盛京医院
中国医科大学附属盛京医院
华中科技大学同济医学院附属同济医院
党政职能科室
第二临床学院
[2] 华中科技大学同济医学院附属同济医院血液科
华中科技大学同济医学院附属同济医院
血液内科
出处:
ISSN:
关键词:
异柠檬酸脱氢酶1
差异表达
基因芯片
GEO数据库
生物信息学
摘要:
目的从分子水平揭示合并异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)基因突变的正常核型急性髓系白血病(CN-AML)患者的发病机制,为临床诊疗提供新工具。方法在GEO中检索IDH1突变的AML芯片数据,使用BRB-Array Tools、GSEA、MILANO、GAD、GATHER等生物信息学工具进行统合分析。结果经过2组样本数据的统合分析,发现12个差异表达基因,主要集中在细胞粘附、免疫防御反应等生物学过程。与参与凋亡、Toll-like、Jak-Stat等信号通路有关。GSEA分析表明IDH1相关基因分别涉及到脂质代谢、髓系细胞分化和缺氧调节等方面。结论利用生物信息学的方法能提取基因芯片有效信息,为进一步深入研究IDH1在CN-AML的发病机制中的作用开辟新思路。
基金:
国家杰出青年科学基金资助项目(81025011)
第一作者:
第一作者单位:
[1] 华中科技大学同济医学院附属同济医院第二临床学院
[2] 华中科技大学同济医学院附属同济医院血液科
推荐引用方式(GB/T 7714):
周匡果,黄亮,周剑峰.急性髓系白血病中异柠檬酸脱氢酶1基因突变的生物信息学分析[J].华中科技大学学报(医学版).2012,41(04):404-408.