资源类型：
收录情况：
◇ 统计源期刊
◇ CSCD-E
文章类型：
单位：
[1] 华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系环境与健康教育部重点实验室
[2] 华中科技大学同济医学院附属同济医院胸外科
华中科技大学同济医学院附属同济医院
外科学系
胸外科
出处：
ISSN：
关键词：
肺鳞癌
lncRNA分子标签
TCGA数据库
预后
预测模型
摘要：
目的:通过对TCGA数据库的挖掘,筛选与肺鳞癌预后相关的lncRNA。方法:提取TCGA数据库中肺鳞癌患者临床数据以及肺鳞癌和癌旁组织中的lncRNA表达数据,采用LASSOCox回归筛选肺鳞癌预后相关的lncRNA,并构建lncRNA分子标签。采用Cox模型研究该分子标签的表达水平对肺鳞癌患者预后的影响。结果:首先筛选出322个在癌和癌旁组织中差异表达的lncRNA。经LASSOCox回归分析从中筛选出6个与肺鳞癌预后相关的lncRNA,分别为KTN1-AS1、FAM83A-AS1、AF131217.1、RP11-108M12.3、CTD-2555C10.3和AC068831.16。根据这6个lncRNA构建的分子标签表达水平中位数-0.09将肺鳞癌病人分为高表达组和低表达组,高表达组病人死亡风险是低表达组的2.14倍（HR=2.14,95%CI:1.50～3.04,P(0.01）。预测模型的Harrell’sC统计量为0.69（95%CI:0.64～0.75）。结论:通过对TCGA数据库的挖掘,发现KTN1-AS1、FAM83A-AS1、AF131217.1、RP11-108M12.3、CTD-2555C10.3和AC068831.16对肺鳞癌的预后有影响,且构建的lncRNA分子标签表达水平与肺鳞癌病人的预后有显著性关联。
基金：
国家自然科学基金资助项目(NFSC81773520,NFSC81703552)
第一作者：
第一作者单位：
[1] 华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系环境与健康教育部重点实验室
通讯作者：
推荐引用方式(GB/T 7714)：
刘颖,王可,何杨婷,等.基于TCGA数据挖掘筛选肺鳞癌预后相关lncRNA分子标签[J].癌变·畸变·突变.2018,30(06):468-472+478.
