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◇ 统计源期刊
◇ CSCD-E
文章类型：
单位：
[1]华中科技大学同济医学院附属同济医院肿瘤中心
华中科技大学同济医学院附属同济医院
肿瘤科
出处：
ISSN：
关键词：
胶质母细胞瘤
LncRNA
TCGA数据库
Cox回归模型
摘要：
目的利用TCGA数据库建立胶质母细胞瘤患者预后的LncRNA风险评分模型。方法下载TCGA数据库中胶质母细胞瘤及正常神经组织的基因表达谱数据、临床相关数据,筛选差异表达LncRNA,采用单因素和多因素Cox风险回归模型筛选和建立LncRNA预后模型。结果从TCGA数据库中得到169份胶质母细胞瘤组织和5份正常神经组织的基因表达谱,使用R语言edgeR包进行差异基因分析（logFC≥2或≤-2,FDR(0.05）得到差异基因7 978个,其中差异LncRNA 1 643个。单因素Cox分析及多因素Cox回归分析得到基于4个LncRNA的多因素预后风险模型:风险评分=0.59×NDUFB2-AS1-0.41×ZEB1-AS1+0.31×AL139385.1+0.21×AGAP2-AS1。模型的ROC曲线下面积AUC=0.864。患者风险评分结果提示高评分患者预后较低评分患者差。结论 NDUFB2-AS1、ZEB1-AS1、AL139385.1和AGAP2-AS1的风险预测模型可有效预测胶质母细胞瘤患者的预后,有望用于指导临床治疗。
第一作者：
第一作者单位：
[1]华中科技大学同济医学院附属同济医院肿瘤中心
通讯作者：
推荐引用方式(GB/T 7714)：
彭慧,秦凯,戴宇翃,等.基于TCGA数据库的胶质母细胞瘤LncRNA风险预测模型的建立[J].肿瘤防治研究.2019,46(05):417-420.
