一种治疗HPV感染的纳米粒制剂,其特征在于,包括聚(β氨基酯)聚合物和靶向敲除或敲降HPV的重组质粒DNA;所述靶向敲除或敲降HPV的重组质粒DNA选自靶向敲降或敲除HPV的短发夹RNA重组质粒DNA、靶向敲除或敲降HPV的锌指核糖核酸酶的重组质粒DNA、靶向敲除或敲降HPV的转录激活因子样效应物核酸酶的重组质粒DNA以及靶向敲除或敲降HPV的规律成簇的间隔短回文重复的重组质粒DNA中任一种或几种的混合;所述靶向敲除或敲降HPV的重组质粒DNA的核苷酸序列选自SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7以及SEQ ID NO.8所示的核苷酸序列中任一种或几种的混合。