目的分析新型冠状病毒肺炎合并动脉硬化患者的肠道菌群组成及功能特征,为临床合理使用肠道微生态调节剂提供理论依据。方法招募2020年4月5日至4月19日之间收住在我院的新型冠状病毒肺炎患者为研究对象,按动脉硬化检测结果分为硬化组和对照组。入院7 d内采集粪便样本,提取肠道菌群DNA并建库,采用鸟枪法进行宏基因测序,基于测序结果进行生物信息学分析。结果本研究共纳入16例新型冠状病毒肺炎患者,硬化组7例,对照组9例。硬化组baPWV值及血压值高于对照组（P(0.05）。肠道菌群物种分析结果:门水平beta多样性分析显示组间肠菌群落构成差异明显（P(0.05）。与对照组相比,硬化组患者粪便微生物中Holdemanella、Mitsuokella、Deinococcus、Lachnospira、Turicibacter、Butyrivibrio、Sporomusa、Halanaerobium相对丰度显著降低,这些菌群与产生SCFAs、调节能量代谢、抗辐射、抗氧化应激和抗炎作用相关。KEGG通路富集分析结果:对照组菌群功能主要富集在脂多糖生物合成、短链脂肪酸代谢、其他氨基酸代谢及膜运输等通路上,硬化组主要富集在氨基酸代谢和DNA损伤修复通路上。结论新型冠状病毒感染后,患者使用增加短链脂肪酸的微生物制剂可能有助于恢复肠道菌群稳态。