目的：比较肺孢子菌（PC）与巨细胞病毒（CMV）引起的间质性肺炎（IP）发病初期的不同特征，提高临床诊断和治疗水平。方法：回顾性收集3家教学医院临床确诊的正常免疫状态PC导致的IP患者（PC组,n=7）、肾移植（KP）随访过程中诊断的PC-IP患者（KT-IP组,n=10），肾移植随访过程中诊断的CMV导致的IP患者（CMV组,n=16）。统计分析3组患者入院时的一般资料、病史、症状体征、实验室检查、CT影像学资料。结果：（1）全部患者均出现IP的特征性表现：以缺氧表现为核心的临床症候群、C-反应蛋白升高、双肺弥散大面积毛玻璃样CT影像学改变；（2）基于肺泡灌洗液/血清学的病原学筛查可以快速鉴别PC和CMV；（3）微小结节和气囊样病变是CMV-IP特征性的CT影像表现。结论：在出现IP特征性表现的患者中，结合肺泡灌洗液/血清学的病原学筛查和CMV-IP的CT特征性表现，可以迅速鉴别诊断PC与CMV导致的间质性肺炎。