目的：探讨乌梅丸对肥胖小鼠肠道菌群结构的影响。方法：利用高通量基因测序技术，对正常对照组小鼠、高脂饮食诱导的模型组肥胖小鼠和乌梅丸干预后的肥胖小鼠的粪便样本进行16SrRNA测序，比较分析各组小鼠肠道菌群结构的差异，并用PICRUSt 软件预测差异功能通路。结果：乌梅丸干预后，肥胖小鼠的体质量显著下降，白色脂肪细胞体积减小，白色脂肪纤维化程度减轻；同时肠道菌群结构发生显著改变，乌梅丸不仅改变了肥胖小鼠肠道多样性，使其趋近于正常对照组小鼠，还在门、属、种3个水平上显著改变了肥胖小鼠的肠道细菌分布比例，使肥胖小鼠肠道内4个菌门、9个菌属、4个菌种的丰度趋近于正常对照组小鼠肠道丰度水平，肠道益生菌（多形拟杆菌、Parabacteroides＿goldsteinii、狄氏副拟杆菌）丰度显著上升，且能降低厚壁菌门/拟杆菌门比率。此外上述肠道菌群的改变可引起卟啉与叶绿素代谢、二甲苯退化、D-精氨酸和D-鸟氨酸代谢、苯甲酸降解、生物膜形成-霍乱弧菌、RNA转运、类黄酮生物合成7个通路功能的改变。结论：乌梅丸可以治疗小鼠肥胖症，改变肥胖小鼠肠道菌群结构。