目的观察氯喹（CQ）对结直肠癌干细胞转移能力的影响,并探讨其机制。方法利用流式细胞仪从LoVo细胞和人结直肠癌小鼠移植瘤模型（xhCRC）单细胞悬液中分选出CD133+细胞和CD133-细胞,利用体外细胞球体形成实验检测两群细胞自我更新能力。利用Transwell侵袭和迁移实验检测浓度为10μmol/L和50μmol/L CQ对CD133+LoVo细胞和CD133+xhCRC细胞转移能力的影响。通过膜联蛋白V（Annexin V）-藻红蛋白（PE）/7-氨基放线菌素D（7-AAD）细胞凋亡检测试剂盒检测CQ对CD133+LoVo细胞和CD133+xhCRC细胞凋亡的影响;Western blot检测CQ对凋亡相关蛋白裂解半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶-3（Cleaved Caspase-3）和上皮-间充质转化（EMT）相关蛋白E-钙黏蛋白（E-cadherin）、波形蛋白（Vimentin）和Snail的表达的影响。结果体外球体形成实验结果显示,CD133+细胞比CD133-细胞具有更强的体外形成球体的能力（P=0.004）。Transwell侵袭实验结果显示,在CD133+LoVo细胞中,浓度为10、50μmol/L的CQ处理细胞24 h,穿过小室的细胞数分别为71、42个,与对照组（115个）比较,差异有统计学意义（P=0.008、0.001,实验组间比较,P=0.009）;在CD133+xhCRC细胞中穿过小室的细胞数分别为41、22个,与对照组（61个）比较,差异有统计学意义（P=0.044、0.001,实验组间比较,P=0.036）;Transwell迁移实验结果显示,在CD133+LoVo细胞中,浓度为10、50μmol/L的CQ处理细胞24 h,穿过小室的细胞分别为179、95个,与对照组（290个）比较,差异有统计学意义（P=0.001、0.000,实验组间比较,P=0.000）,在CD133+xhCRC细胞中穿过小室的细胞分别为61、43个,与对照组（97个）比较,差异有统计学意义（P=0.017、0.002,实验组间比较,P=0.096）。细胞凋亡实验结果显示,浓度为10μmol/L和50μmol/L的CQ处理CD133+LoVo细胞,细胞凋亡率分别为（2.9±0.4）%、（17.7±1.5）%,与对照组[（0.1±0.6）%]比较,差异均有统计学意义（P=0.001、0.000）,实验组间比较,P=0.000);处理CD133+xhCRC细胞,细胞凋亡率分别为（9.7±0.4）%、（17.6±2.3）%,与对照组[（1.0±0.6）%]比较,差异有统计学意义（P=0.003、0.000,实验组间比较,P=0.005）。Western blot证实CQ可促进凋亡相关蛋白Cleaved Caspase-3的表达并呈剂量依赖关系,E-cadherin的表达随CQ浓度的增加逐渐减少。结论CQ可抑制结直肠癌癌干细胞（CSCs）的转移能力,下调EMT相关蛋白表达并诱导其凋亡。